Хватило отменить проведение всей реализации и опять перепровести реализацию при помощи групповой обработки, чтобы минуса исчезли (хотя и не все!!!, пришлось еще пересмотреть позиции с минусом через карточку счета). Думаю причиной послужило несвоевременное подключение автоматической переоценки валют. Но тем не менее, вроде программа, вроде умная, могла бы и подсказать...
Могу ошибаться, конечно